儿童做支气管镜的危害有麻醉风险、呼吸困难、缺氧等。小儿支气管镜一般不会配合，一般会有以下几种危险因素：
1、麻醉风险：麻醉时有可能发生麻醉事故，有时麻醉后会有后遗症。
2、呼吸困难：由于孩子不配合检查，会导致咽喉水肿，呼吸困难。
3、缺氧：一些具有高度反应能力的儿童，可发生严重的支气管痉挛，造成缺氧，甚至有生命危险。