肺间质疾病是一组主要侵犯下呼吸道的弥漫性肺部疾病，病因即可以是感染性的因素，也可以是非感染性因素。
感染因素，比如病毒可以导致间质性肺炎，非感染性的病因较多，常见原因，一是过敏性炎症反应，可以导致间质性的改变。此外，结缔组织病，如红斑狼疮、硬皮病等，常可以引起肺间质改变。
此外，还有物理化学性损伤，药物也可以导致肺间质的炎症改变。再者，恶性肿瘤也可以侵犯肺间质，形成肺间质的改变。