急性肺栓塞确诊后立即按照流程进行抢救治疗，对于血流动力学不稳定的肺栓塞患者，在无溶栓禁忌症的情况下立即开始溶栓治疗，而有溶栓禁忌症者可予以低分子肝素皮下注射后再加用华法林单药抗凝治疗，待病情及条件容许下还可以行经导管血栓摘除术的介入治疗。
而对于血流动力学稳定的肺栓塞患者，在无抗凝禁忌症下可以予以低分子肝素或华法林、利伐沙班等抗凝剂治疗。