早晨第一口痰褐色粘稠是由于鼻炎、肺脓肿、支气管扩张等原因导致的。它是因为病毒、细菌、支原体、衣原体、立克次体等病原体侵入人体，会导致呼吸道粘膜充血、水肿、大量的炎性物质流出，同时还会有大量的组织碎片掉落，这些组织的残渣会随着纤毛的移动而从下往上排出。有些患者长时间吸烟、吸毒，有害物质刺激也会导致早晨第一口痰褐色粘稠。