毛细支气管炎的发病机制是呼吸道感染等。当前对其免疫机理的研究较为集中，有一些证据显示，由呼吸道合胞病毒所致的毛细支气管炎，其病因与免疫功能有关。首先，毛细支气管炎婴儿的分泌物中，含有抗呼吸道合胞病毒IgE。近年来，通过对婴幼儿及动物模型的研究，发现当感染呼吸道合胞病毒时，会释放出大量的可溶性成分，如白介素、白三烯、趋化因子、炎症及组织损伤等。