肺栓塞肝素应用禁忌症包括不能控制的活动性出血、外伤或术后渗血等。肺栓塞是一类疾病，主要有肺血栓栓塞症、脂肪栓塞综合症、羊水栓塞、空气栓塞等，肺栓塞是最常见的一类疾病，如果没有任何禁忌症，发病时间不超过14天，可以及早进行溶栓，溶栓后继续灌药，肝素是临床上常用的药物。
第一、不能使用肝素过敏症。
第二、不能用于治疗急性细菌性心内膜炎。
第三、是血小板减少、有活动性出血、凝血功能紊乱、严重高血压等。