肺脓肿术后可能会感染其他器官。肺脓肿术后，由于其易于传播，会蔓延，从而引起其他脏器的感染。术后的感染要进行细菌培养、药物敏感性试验，结合药物敏感性试验，可以选用敏感的抗生素进行抗菌治疗。这种方法的疗效要高于单纯地使用广谱抗生素，也可以单独使用一种敏感的抗生素。在术中用抗生素清洗术野，是为减少其他脏器的感染。胸腔积液要尽早进行穿刺抽液，以免肺部受到肺部的压迫和感染。