支原体脑炎主要是通过抗生素进行治疗的。支原体脑炎大部分是因为受到细菌感染引起的，如果不能及时治疗，可能就会留有后遗症。因此，支原体脑炎会根据病情严重程度，采用阿奇霉素等药物进行治疗，如果病情比较严重，还应配合脑细胞营养药物，甘露醇等药物进行治疗，如果出现发烧情况，当体温超过38度5后，还要在医生指导下使用退烧药物。