新生儿呼吸困难的原因，应该及早到医院进行检查，查明病因以后再针对性治疗。如果新生儿出现呼吸困难，可能是由于呼吸系统本身的原因、肺外的原因。例如，新生儿重症肺炎、新生儿呼吸窘迫综合征、新生儿肺不张、新生儿肺气肿、新生儿气胸、新生儿肺发育畸形等均可引起呼吸困难。有先天性心脏畸形，也会导致呼吸困难。腹部和胃内容物的增加导致横膈膜上升，对肺部的压迫也会导致呼吸困难。