通常情况下，跑完步第二天膝盖疼，可以通过使用药物、物理治疗等方式将进行治疗。
1.使用药物：跑完步第二天膝盖疼。患者可以在医生的指导下使用乐葆、藤黄健骨丸、复方伤痛胶囊、滑膜炎颗粒等药物进行治疗，这些药物能起到活血化瘀、散寒止痛、消肿等作用。
2.物理治疗：跑完步第二天膝盖疼，患者可以通过按摩、针灸来缓解症状。