跑步后右侧膝盖内侧疼是膝关节内侧半月板损伤、右膝鹅足滑囊炎、右胫骨平台内侧髁骨水肿等原因导致的，具体分析如下：
1.膝关节内侧半月板损伤：内侧半月板位于膝关节内侧，股骨内髁与胫骨内侧平台之间，起到缓冲和稳定膝关节的作用。
2.右膝鹅足滑囊炎：鹅足下的滑囊部位，因慢性劳损后产生疼痛。
3.右胫骨平台内侧髁骨水肿:常见于一些比较胖的年轻患者，短时间内长距离的跑步，导致股骨内髁骨水肿，从而出现疼痛。