脚踝扭伤之后三个月仍然疼，主要是两方面的原因：
第一种情况，可能是脚踝扭伤之后没有完全恢复，形成无菌性炎症病灶，特别是在受凉以及活动的时候，疼痛感更加明显。
第二种情况，可能是踝关节周围的软组织出现了粘连，进行活动的时候，就会对粘连组织产生牵拉，而出现脚踝部位明显的疼痛感。
可以去医院进行踝关节磁共振检查，还要进行踝关节屈伸功能锻炼，避免关节粘连的更加严重。