一般来说，纤维肌痛综合症目前病因不清、病理生理不明，通常没有特效的治疗方式，可以通常药物治疗、非药物治疗进行处理。
1、药物治疗：纤维肌痛综合症首选的药物是抗抑郁药阿米替林，通常可以达到较好的治疗效果。
2、非药物治疗：纤维肌痛综合症还可以通过水浴疗法、认知行为治疗等方式减少药物不良反应，还可以在医生的指导下通过针灸、按摩等方式进行治疗。