先天性马蹄足矫正后是否有后遗症要根据治疗方法和病情程度来确定。对于病情较轻的先天性病人，可以通过手法和石膏的矫正，后遗症比较少；但若症状严重，需要手术治疗，后遗症则较多，常见后遗症有愈合不良、感染、炎症等情况，部分患者矫正后会出现关节退变关节炎，需再次进行手术，而且因为病情的进展，存在着马蹄复发的可能性。