骨囊肿与骨巨细胞瘤的区别有很多，主要就表现在以下这几个方面：
1、发病原因不同，骨囊肿是由于骨质外伤或者是胚胎发育异常等因素所导致的疾病，而骨巨细胞瘤是由于年龄因素、性别因素以及致病菌感染所引发的疾病。
2、发病人群不同，骨囊肿一般在青少年以及儿童当中发作，而骨巨细胞瘤主要就在青壮年女性当中发作。
3、发病症状不同，骨囊肿的症状表现在关节疼痛、肿胀等方面，而骨巨细胞瘤的症状则表现在局部肢体疼痛、起肿块等方面。