小儿脊柱畸形原因有先天性胚胎发育异常或紊乱、环境因素、继发疾病等。先天性儿童脊柱畸形的病因是先天性胎儿发育不良，而环境因素则会引起脊柱或脊髓的发育障碍，从而引起胎儿晚期或胎儿的先天性脊柱或脊髓的畸形，表现为脊膜膨出、脊髓纵裂、蝴蝶椎等。继发疾病如椎管肿瘤、脊柱感染、血液病、外伤等也会引起脊柱序列的异常发展，从而引起脊柱侧弯、后弯或其它复杂的畸形。