临床中，多数的腱鞘囊肿还是以手术切除为主要的治疗方法，尤其对于腱鞘囊肿已经比较大，质地比较硬，时间较长的，需要积极地进行手术治疗。
在局麻下进行手术切除囊肿，通常以囊肿大小为中心，逐层地切开皮肤，皮下组织及深筋膜，小心地进行剥离，保护好周围的血管、神经、肌腱，然后进行囊肿切除就可以了。