第五跖骨基底部骨折后遗症主要是疼痛。第五跖骨基底骨折最大的特征是骨折的延迟愈合及不连，应尽早进行手术治疗。主要采用张力带内固定和空心螺钉内固定等方法。术后、治疗后或未治疗引起的骨折延迟愈合，其后遗症以疼痛为主。患者在走路和足部活动时会有长期的痛苦。患者的脚扭伤后，持续的疼痛无法减轻，并且仅限于足背或者偏外侧，需要考虑是不是伴有第五跖骨的基底骨折。