目前来说，会得胆囊腺肌症的原因并不明确。
胆囊腺肌症是一种原因不明的良性增生性疾病。其以慢性增生为主，兼有退行性改变。目前认为，胆囊腺肌症的发病原因最有可能和胆囊异常收缩，导致胆囊腔内压力增高有关。这会导致罗-阿氏窦形成，并出现数目增多，扩大呈囊状，深入肌层，甚至可以达到胆囊的浆膜层。这可以促使粘膜内憩室形成，最终形成壁间结石。胆囊腺肌症很少出现癌变，但一般还是建议腹腔镜下胆囊切除术。