生理性卵巢囊肿可能会有腹部肿物、小腹疼痛、月经失常等症状及表现，有些患者可能还会出现压迫症状。
1、腹部肿物：患者按腹部可以发现腹内肿物、腹胀不适，或在妇科检查时发现附件肿块。
2、小腹疼痛：卵巢囊肿患者感觉腹痛，尤其忽然发生者，多系囊肿蒂发生扭转，偶或为囊肿破裂、出血或感染所致。
3、月经失常：一侧卵巢甚至双侧卵巢囊肿，由于并不破坏所有的正常卵巢组织，故多半不引起月经失常。而月经失常患者常伴有卵巢生理性囊肿，如卵泡囊肿等，部分患者会因卵巢囊肿影响卵巢的内分泌功能而出现绝经后出血的现象。
4、压迫症状：如膀胱受压，可引起尿频、尿急、排尿困难或尿潴留；如压迫消化道，可引起上腹不适、食欲减退、下坠感或排便困难。