患者三个月不来月经，有以下的原因：
1、由于此时卵巢、下丘脑、垂体、性腺轴还没有完全建立，卵巢的功能不是十分健全，青春期的女孩子月经也就不是十分规律了。
2、青春期的女孩月经不规律与家族遗传、本人的营养状况、激素水平、所处的环境都有关系。
3、体型过于娇小瘦弱、体重偏轻、体脂不够、不爱运动、挑食、爱吃冷饮，也容易引起月经不规律。