药流一般是指药物流产。药物流产后肚子疼痛，是药物的作用引起的。在药物流产的过程中，一般应用的是米非司酮片和米索前列醇片的配合，可以促进子宫收缩，使胚胎流出，可能会出现子宫收缩性的疼痛，在胚胎流出之后，子宫内膜分泌前列腺素会使子宫恢复流血减少。
如果是在药物流产后，胚胎已经清除一周左右出现的肚子疼，可以考虑是有盆腔炎，子宫内膜受到感染引起的。