通常卵巢早衰与多囊卵巢综合征相比，卵巢早衰比较不好治疗。因为卵巢早衰是卵巢功能减退，甚至衰竭，女性不能产生卵泡，其生育功能基本消失，雌激素水平下降，可能出现盗汗、潮热、失眠等症状。中期可能有泌尿生殖系统问题，比如尿道炎、阴道炎、阴道干涩等情况，还可能增加远期骨质疏松、心血管疾病、老年痴呆等风险。
而多囊卵巢综合征女性不排卵，月经不正常，按时卵巢功能正常，可能卵巢癌、子宫内膜癌等风险较大，女性没有生育要求，及时调经即可，有生育要求，可以促排卵治疗。