顽固的失眠患者可以进行药物治疗，并与综合心理治疗方法一起治疗。
药物治疗应选择适合不同类型失眠的药物。对于睡不着觉的患者，可以使用半衰期短的镇静剂催眠剂，如唑烷、三唑仑、水合氯醛等。对于难以维持睡眠的患者，应选择延长NREM睡眠的深度睡眠药。咪唑酮、三唑仑、阿普唑仑可用于半夜容易醒的患者，而雌唑仑、氯硝西泮、氟替唑潘可用于半夜容易醒的患者。对于早上容易起床的患者，可以使用半衰期较长或中等程度的镇静剂催眠剂（如安定、雌唑仑、氯硝西泮等）。对于抑郁症患者，可以使用米氮平等抗抑郁药物来增加睡眠。