一些甲状腺炎会引起头痛，如亚急性甲状腺炎。通常发病前1-3周有病毒性咽炎，或其他病毒感染症状，颈部出现明显疼痛，同时耳旁头部放射痛，可伴有发热、心动过速、多汗等症状。
此外，急性化脓性甲状腺炎表现为甲状腺局部发红、疼痛，可伴有耳、下颌或头枕部放射痛。患者全身中毒症状明显，可伴有发热、全身不适、出汗、乏力等症状，但大多数慢性甲状腺炎患者通常无明显症状。