甲状腺两边不一样大的原因如下：
1、甲状腺异常可能导致双侧甲状腺不对称，甲状腺不对称可能是单侧甲状腺肿胀或对侧甲状腺缩小，都是比较常见的原因。
2、甲状腺疾病可能导致甲状腺变大或变小。甲状腺疾病常见有甲状腺肿瘤、甲状腺结节、甲状腺囊肿、桥本甲状腺炎或急慢性甲状腺炎等，可引起甲状腺肿或甲状腺萎缩。甲状腺两边不一样应该马上去医院的内分泌科进行相关的检查，其中包括甲状腺功能检查以及甲状腺彩超检查。