甲状腺激素抵抗综合征宜采用基因治疗的方法进行，但目前不能基因治疗的可采用抗甲状腺药物治疗。
有些患者在该病发生时以甲状腺功能亢进症为主要症状，此时可以用抗甲状腺药治疗。甲状腺功能减退症症状为主要表现时，可用左甲状腺激素替代治疗。有研究表明，肾上腺皮质激素和溴隐亭对该病有一定疗效。利用多巴胺激动剂治疗该病也有一定效果。本病为罕见病、罕见病，全球目前不到500例。所以，如果患者出现甲状腺功能亢进症样症状，疗效差，可以去医院详细检查。为了能检查，必须去更大的医院。