儿童甲状腺激素分泌不足可能有多种因素：
第一，先天性甲状腺功能减退，根据病变部位可分为原发甲低和继发性甲低。原发甲低是甲状腺自身疾病所致，最常见病因是甲状腺先天性发育异常或甲状腺素合成缺陷继发甲低是下丘脑和垂体病变所致。
第二，外周甲低是甲状腺激素受体功能不全所致。
第三，获得性甲状腺功能低下是由慢性淋巴细胞性甲状腺炎引起的。第四，部分患儿可能是母亲孕期饮食中碘缺乏所致。