甲状舌管囊肿患者一般无自觉症状，多见于1至10岁儿童，部分见于成人。
生长缓慢，质地柔软，发生在颈中心线，有时向左或向右稍倾斜，高度在舌骨上下附近。这有其特点依据，多可随着吞咽、伸舌运动上下移动。许多患者发现自己患了甲状舌管囊肿，都是通过他人、亲戚朋友发现的。但甲状舌管囊肿可感染，感染后可突然体积增大，形成疮孔导管，穿刺不透明，呈稍浑浊黄色浅粘稠液体。甲状舌管囊肿的切除必须彻底。大部分与舌骨粘连，或直接通过舌骨，需要舌骨内逐片切除。否则，非常容易复发。甲状舌管囊肿如果长期治不好，也有可能癌变。