甲状腺切除后，最大的益处是可以消除原有的甲状腺疾病，同时可以避免甲状腺癌的发病。
另一方面，甲状腺切除后的弊端也比较大。甲状腺分泌甲状腺激素，是人体必需的激素，因此终身服用甲状腺激素的替代治疗也是必要的。此外，手术完全切除甲状腺可能同时切除甲状旁腺，可能导致患者钙磷比例失衡，出现惊厥症状，术后需补钙治疗。