甲状腺过氧化物酶抗体高是因为免疫系统有错误，抗过氧化物酶抗体高的临床诊断为桥本氏甲状腺炎，又称慢性淋巴细胞性甲状腺炎。
产生抗过氧化物酶抗体表明身体中会发生自身免疫防御反应，但不会损伤甲状腺，因为自身免疫炎症导致的甲状腺增大往往最终会缩小。甲状腺不断破坏、损伤，需要合成分泌甲状腺激素不足时，会出现甲状腺功能减退。桥本氏甲状腺炎确诊后行甲状腺超声诊断，无高恶性风险结节，无甲状腺功能异常，无需特殊治疗，定期复查即可。如果出现甲状腺功能下降，要用左甲状腺激素钠替代治疗，维持甲状腺功能正常，不需要特殊的饮食和药物注意。