甲状腺减退的治疗，主要是药物替代治疗，目前可供选择的药物有左甲状腺激素片、甲状腺片。通常推荐使用左甲状腺激素片，药物剂量相对稳定。
在替代治疗过程中，起始剂量一定要少，因为起始剂量过多的话，甲减患者容易出现胸闷、心绞痛等相关症状。需定期随访，根据甲状腺功能结果逐渐调整药物剂量，达到稳定期后甲状腺功能减退症可达到临床缓解。