甲状腺过氧化物酶抗体升高，多见于自身免疫性甲状腺疾病。特别是桥本氏甲状腺炎和弥漫性甲状腺肿，伴随甲状腺功能的抗体均有上升的可能，桥本氏甲状腺炎多上升。这是因为机体将甲状腺变为抗原，产生甲状腺自身抗体，往往有抗甲状腺球蛋白抗体、抗微粒体抗体、促甲状腺激素受体抗体。
桥本氏甲状腺炎的过氧化物酶抗体、球蛋白抗体、微粒体抗体涨幅非常高，弥漫性甲状腺肿轻度升高。在系统性红斑狼疮、多发性肌炎等自身免疫性疾病中，即使是这些自身免疫性疾病，由于机体对自身组织的认识不明确，也有可能产生抗体而发生疾病。发生抗体上升时，确定是什么疾病导致的抗体上升，并进行对症治疗。