甲状腺球蛋白抗体高是自身免疫性甲状腺疾病的原因，甲状腺球蛋白抗体高通常提示桥本甲状腺炎的可能。这种自身抗体容易给甲状腺带来淋巴细胞浸润、免疫系统改变等，有时还会引起甲状腺功能障碍。
甲状腺球蛋白抗体高，同时高抗体伴甲状腺过氧化物酶，这些自身抗体导致甲状腺功能改变，最常见的是甲状腺功能减退症。如果这两种抗体水平升高而发生甲状腺功能减退症，通常需要在医生的指导下应用左甲状腺激素钠进行替代治疗。但如果甲状腺球蛋白抗体高，患者甲状腺功能正常，定期随访即可。通常情况下，对于甲状腺球蛋白抗体高的患者，建议在日常生活中减少碘的摄入。