甲状腺肿痛的主要原因有急性化脓性甲状腺炎引起的，也有亚急性甲状腺炎引起的，这两个原因是引起甲状腺肿痛的主要原因。具体如下：
1、如果是急性化脓性甲状腺炎，则需要进行手术引流处理。
2、亚急性甲状腺炎的主要特点是甲状腺疼痛和颈部增粗，一般使用非甾体类抗炎药，大多数患者疼痛消失，必要时可以进行激素处理。具体用药请根据自身情况在专科医生指导下用药。