甲状腺炎患者明确为细菌炎症引起的急性化脓性甲状腺炎时，可服用头孢菌素类或青霉素类消炎药，如头孢呋辛酯或阿莫西林克拉维酸钾等。
病毒感染引起甲状腺炎的情况下，服用抗炎药物症状往往不会好转。该病毒感染引起的甲状腺炎是由流感病毒和腺病毒引起的，因此需要口服非甾体类消炎药才能有效缓解甲状腺炎症状。可以先口服布洛芬缓释片或洛索芬钠片。如果患者症状不能缓解，也可以采用激素类药物口服治疗。