抗甲状腺抗体检查主要包括甲状腺球蛋白抗体、甲状腺过氧化物酶抗体、促甲状腺激素受体抗体等，甲状腺过氧化物酶抗体检测主要用于Graves病、自身免疫性甲状腺炎等自身免疫性甲状腺疾病的诊断。
甲状腺球蛋白抗体的测定主要用于自身免疫性甲状腺疾病的诊断，甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体均阳性是桥本病的特点之一，尤其对血清促甲状腺激素水平升高的患者有用。促甲状腺激素受体抗体水平升高，提示甲亢患者病因为Grave's病。在甲亢治疗过程中，主要用于判断药物疗效，同时也是判断停药及预后的参考指标之一。