如果患者甲状腺术后出现咳嗽症状，需要完善血常规、C反应蛋白、降钙素原、病毒抗体、支原体抗体、痰培养、胸片等检测，以评估病原和病原菌不同的病原菌，将采取不同的抗感染治疗措施。
如患者感染细菌，需采用头孢菌素等相关抗生素治疗。患者感染病毒，需口服清热解毒药物，如清开灵、蒲地蓝，必要时口服抗病毒药物，如奥司他大楼、扎那米韦等。患者由不典型病原菌引起时，需使用阿奇霉素、红霉素、左氧氟沙星、莫西沙星等大环内酯类抗生素。