由于颈部解剖复杂、血液丰富，甲状腺手术后的并发症除常见的手术发生出血、呼吸障碍等外，还可能出现以下并发症：
1.喉上神经损伤，甲状腺上极，大张处理结扎甲状腺上动脉，可能不小心刺伤或切除喉上神经，引起声带松弛、环甲肌麻痹。
2.喉返神经损伤在处理甲状腺外侧或下极时易损伤喉返神经，引起声嘶。
3.手足抽搐，手术时误切甲状旁腺可引起低血钙症状，出现手足麻木、抽搐。
4.甲状腺中毒危象，手术时大量甲状腺激素进入血液循环可能诱发甲状腺功能亢进危象。
5.甲减、甲状腺组织切除过多，残留甲状腺功能不足导致甲减。
6.甲状腺功能亢进症复发。