先天性甲状腺功能低下的常见原因有：
1、甲状腺不发达或发育不全。
2、细胞因子合成途径缺乏酶；
3、甲状腺激素缺乏；
4、甲状腺激素靶器官反应降低。产后新生儿期一般行足跟血筛查，可早期发现，需尽快口服细胞因子片。先天性甲状腺功能减退症同时存在甲状腺发育异常，除需终身服药外，其他类型多可在正规治疗2-3年后定期观察停药，最主要临床症状为早期哭声弱、哺乳困难、便秘、黄疸消失等症状。