甲状腺功能减退的最主要危害是导致体内代谢降低，交感神经兴奋性降低。
甲状腺功能减退可由甲状腺手术、甲状腺自身免疫性炎症、碘-131甲状腺治疗引起甲状腺严重损伤，导致甲状腺合成、甲状腺激素分泌不足。甲状腺功能减退表现为低代谢症状，如畏寒、浮肿、体重明显增加、记忆力减退，甚至出现明显嗜睡、嗜睡，同时心脏跳动减慢，严重时心脏增大、心包积液、心功能不全，甚至女性月经紊乱，男性性欲的减退，影响生育，甚至没有及时诊断和治疗，如遇到感染或创伤，诱发黏液水肿性昏迷，即使积极的抢救，生命危险也很高。