甲状腺的疾病有些跟遗传有一定的相关性。
甲状腺疾病中，桥本甲状腺炎，也就是慢性淋巴细胞性甲状腺炎，和弥漫性甲状腺肿合并甲状腺功能亢进症，也就是常见的Graves病，这两种病的发病过程都与自身免疫缺陷有一定的关系。这种自身免疫性疾病有遗传因素，如果父辈有这两种疾病，子辈可能发生甲状腺功能亢进症和甲状腺功能减退症。并非所有疾病都发生原发病遗传，自身免疫性疾病自身抗体有一定遗传度时，会发生家族性、聚集性疾病，对甲状腺两种疾病需要高度重视，但急性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎、高功能腺瘤，这些疾病一般是没有遗传性的。