甲状腺功能减退的治疗方法主要采用合成的甲状腺激素，即左甲状腺激素片替代治疗。
口服左甲状腺激素片可以恢复足够的激素水平，逆转甲状腺功能减退的症状和生命体征。左甲状腺激素片治疗可能终身，主要取决于甲状腺功能减退的原因。左甲状腺激素片的剂量需根据甲状腺功能复检结果进行调整，对于甲减患者，如果服用可能引起甲减或加重甲减的药物，需咨询医生，测定利弊后决定是否中止。另外，在碘不足的地区，为了纠正碘不足，需要给与足量的碘剂。左甲状腺激素片在适量使用时几乎没有副作用。