甲状腺激素水平低，主要危害是导致机体代谢下降和交感神经兴奋性下降。
甲状腺激素分泌减少导致物质代谢下降、能量不足、发热减少，引起畏寒、乏力、心率减慢、食欲下降、贫血等。长时间的物质代谢减少，就会引起营养不良，引起情绪低落、反应迟缓、记忆力减退等。代谢下降累及皮肤，可引起少汗、皮肤干燥、粗糙、头皮屑脱落、手脚皮肤发黄、皮肤温度低、头发稀少等，累及骨骼，可引起骨质疏松、关节疼痛、手脚肿胀等。心脏受到伤害，会出现甲减性心肌病，引起心动过缓、心包积液、心力衰竭。甲减严重的话，会导致粘液水肿性昏迷，甚至死亡。