囊肿是否消失，主要取决于囊肿的良恶性，若为良性，建议随访观察，囊肿一般不消失。恶性的情况，早期的手术切除治疗，囊肿被治疗。但切除甲状腺囊肿后应定期复查甲功，警惕手术后可能甲减。
甲状腺囊肿多为单发结节，多发性结节少见，但甲状腺囊肿一般不消失。甲状腺囊肿需先判断囊肿的良恶性，良性建议早期随访观察，恶性需要手术切除治疗。