甲状舌管囊肿手术是普外科常见的手术，风险不是很大，一般采用Sistrunk手术方式切除。
手术时选择局麻，需要完全切除囊肿或阳痿时，切除舌骨部分完全清除囊壁或窦道，以免复发。手术的范围小，不复杂，所以所需时间不是很长。此外，术中极少出现并发症，常规术后预后良好，因此手术风险小。甲状舌管囊肿体积小，早期无明显症状，一般伴吞咽动作上下移动。囊肿增大后，可能出现压迫感、疼痛、吞咽困难等症状。如果不及时或正确治疗，可能导致囊肿合并感染，严重时可能发生语言障碍。因此一旦发现甲状舌管囊肿，尽早行手术切除治疗，一般预后效果较好。