自身免疫甲状腺病是免疫系统在保护甲状腺时会误伤甲状腺。
因为免疫系统应该会保护人体，但是如果把甲状腺自身的成分，比如甲状腺球蛋白、甲状腺微粒体、促甲状腺激素受体识别为敌人，发生防御反应，就会产生针对这些所谓抗原的自身抗体。自身抗体的出现越来越容易引起甲状腺自身免疫性疾病。此外，这些抗体的出现意味着自身免疫性炎症的出现，像促甲状腺激素受体抗体一样，被称为弥漫性甲状腺肿合并甲亢的自身免疫性甲状腺疾病非常常见。