游离三碘甲状腺原氨酸低有以下三种原因：
一、甲状腺功能减退，甲状腺在工厂合成甲状腺激素。甲状腺激素有助于调节新陈代谢，促进生长发育，但甲状腺激素合成减少，游离的三碘甲状腺原氨酸可能会降低。
二、严重代谢疾病，甚至感染、创伤、手术，甚至严重抑郁焦虑等严重压力下，会发生代偿性代谢减慢，由总T4转化为T3。游离T3水平轻度下降，是这种生物保护性调节反应，无需治疗。
三、垂体功能减退，由于促肾甲状腺激素分泌减少，甲状腺功能减退，这被称为继发性甲状腺功能低下。