新生儿甲状腺功能减退通常在出生后48-72小时进行足底血促甲状腺激素(TSH)筛查。
如果TSH明显高于正常值，则需要重新检查至少三项甲状腺功能：游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)、游离甲状腺激素(FT4)和TSH。如果甲状腺功能提示TSH仍明显高于正常值，则甲状腺功能减退的诊断是明确的。治疗应尽早补充甲状腺激素：左旋甲状腺素钠。并且初始剂量应该很大。可以从每公斤体重10-15ug开始，尽最大努力让甲状腺功能尽快恢复正常，并且要长期治疗，定期复查甲状腺功能，调整药物剂量。