甲状腺囊性结节伴钙化的治疗方法如下：
1、随访观察：在良性情况下且身体没有不适的情况时，可以不进行治疗，但需要随访观察。医生通常根据甲状腺结节的超声检查结果而异，但不通药物的患者在3-12个月期间进行密切随访，观察结节是否生长或是否需要治疗。
2、药物治疗：若检出是良性，无生命危险，可考虑先使用甲状腺激素药物或中药调理治疗等药物治疗。
3、手术治疗：若被诊断为恶性，需行手术。